Plusieurs organisations du secteur aérien, dont ACI EUROPE, Airlines for Europe (A4E) et l'Association du transport aérien international (IATA), ont demandé à la Commission européenne ont appelé la Commission européenne à permettre aux États membres de suspendre temporairement l'application du système d'entrée/de sortie lorsque des difficultés opérationnelles importantes surviennent, notamment durant les périodes de forte affluence. Selon ces organisations, les difficultés observées dans certains aéroports pourraient entraîner des retards importants pendant la période estivale. Des préoccupations similaires ont également été exprimées par le port de Douvres, où des difficultés techniques ont conduit à demander une suspension temporaire du système.

Selon la Commission européenne, environ 20 des quelque 1 500 points de passage aux frontières extérieures utilisant le système d'entrée/de sortie rencontrent actuellement des difficultés opérationnelles. Elle considère toutefois qu'une suspension du système, qu'elle soit générale ou limitée à certains points de passage, pourrait compromettre le calcul de la durée de séjour autorisée des ressortissants de pays tiers. Depuis la mise en service du système, plus de 110 millions d'entrées et de sorties ont été enregistrées et environ 44 500 ressortissants de pays tiers se sont vu refuser l'entrée sur le territoire de l'Union européenne.

La Commission a indiqué qu'elle renforcerait son soutien aux États membres concernés, notamment au moyen d'une assistance opérationnelle et de mesures destinées à améliorer la mise en œuvre du système là où des difficultés subsistent. Elle considère que le système d'entrée/de sortie constitue un élément essentiel de la gestion des frontières extérieures de l'Union européenne et que les difficultés opérationnelles actuelles doivent être résolues sans suspendre son application.

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